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精确测定中华绒螯蟹线粒体全基因组序列的方法

摘要

本发明涉及精准测定中华绒螯蟹线粒体全基因组序列的方法和由该方法得到的全基因组序列。该方法包括步骤:(1)提取中华绒螯蟹肌肉组织中的全基因组DNA,构建基因文库,利用第二代测序技术进行测序;(2)参考近缘物种线粒体全基因组序列对测序读段进行筛选,除去核DNA片段,然后进行线粒体基因组的拼接,再对拼接的线粒体基因组的编码蛋白基因、rRNA和tRNA进行预测注释;(3)将拼装好的线粒体基因组序列和近缘缘物种线粒体基因组序列比对,根据保守区,再参考所述近缘物种的线粒体全基因组序列设计引物,对对应的第二代测序样品进行PCR扩增,利用第一代测序技术测序PCR扩增产物,校正拼接的线粒体基因组序列。该方法具有快速、准确的优点。

著录项

  • 公开/公告号CN109280700A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2019-01-29

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 上海海洋大学;

    申请/专利号CN201811081584.4

  • 发明设计人 吴旭干;张成;成永旭;

    申请日2018-09-17

  • 分类号

  • 代理机构上海天翔知识产权代理有限公司;

  • 代理人刘粉宝

  • 地址 201306 上海市浦东新区临港新城沪城环路999号

  • 入库时间 2024-02-19 06:40:15

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2019-03-01

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12Q1/6869 申请日:20180917

    实质审查的生效

  • 2019-01-29

    公开

    公开

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