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PDBsum: summaries and analyses of PDB structures.

机译:PDBsum:PDB结构的摘要和分析。

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摘要

PDBsum is a web-based database providing a largely pictorial summary of the key information on each macromolecular structure deposited at the Protein Data Bank (PDB). It includes images of the structure, annotated plots of each protein chain's secondary structure, detailed structural analyses generated by the PROMOTIF program, summary PROCHECK results and schematic diagrams of protein-ligand and protein-DNA interactions. RasMol scripts highlight key aspects of the structure, such as the protein's domains, PROSITE patterns and protein-ligand interactions, for interactive viewing in 3D. Numerous links take the user to related sites. PDBsum is updated whenever any new structures are released by the PDB and is freely accessible via http://www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/pdbsum.
机译:PDBsum是一个基于Web的数据库,主要提供关于蛋白质数据库(PDB)上每个大分子结构的关键信息的图形摘要。它包括结构图像,每个蛋白质链二级结构的注释图,由PROMOTIF程序生成的详细结构分析,汇总的PROCHECK结果以及蛋白质-配体和蛋白质-DNA相互作用的示意图。 RasMol脚本突出显示了结构的关键方面,例如蛋白质域,PROSITE模式和蛋白质-配体相互作用,以便在3D模式下进行交互式查看。许多链接将用户带到相关站点。 PDB发布任何新结构时,都会更新PDBsum,并可通过http://www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/pdbsum免费访问。

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