ПОЛНОГЕНОМНЫЙ ПОИСК АССОЦИАЦИЙ КАК МЕТОД АНАЛИЗА ГЕНЕТИЧЕСКОЙ АРХИТЕКТУРЫ ПОЛИГЕННЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ (НА ПРИМЕРЕ РАССЕЯННОГО СКЛЕРОЗА)

摘要

Полногеномный поиск ассоциаций (genome-wide association study, или GWAS) является мощным инструментом исследования генетической архитектуры полигенных заболеваний человека, который применяется для выявления генетических факторов, связанных с риском развития, клиническими фенотипами и эффективностью лечения этих заболеваний. Этот метод основан на определении частот одно-нуклеотидных полиморфных вариантов (single nucleotide polymorphism, SNP), распределенных по всему геному, с использованием микрочипов или других технологий, которые позволяют одновременно гено-типироватьот нескольких десятков тысяч до нескольких миллионов SNP в одном образце. Возможность обнаружения SNP с высокозначимыми различиями в частотах между сравниваемыми группами больных и индивидов контрольной группы сделала GWAS методом, широко используемым для изучения генетической предрасположенности к комплексным заболеваниям, формирующимся на полигенной основе. На примере рассеянного склероза (PC), который может служить прототипом всех комплексных заболеваний, мы рассматриваем основные достижения и проблемы, связанные с применением GWAS для выявления генов, вовлеченных в развитие PC, расширения на этой основе представлений о молекулярных механизмах, участвующих в патогенезе, и идентификации генетических факторов риска.