МЕТИЛИРОВАНИЕ ГРУППЫ ГЕНОВ микроРНК ВОВЛЕЧЕНО В РЕГУЛЯЦИЮ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ-МИШЕНЕЙ RAR-beta2 И NKIRAS1 ПРИ РАКЕ ЛЕГКОГО

摘要

К настоящему времени известно более 2000 микроРНК человека, каждая из которых может участвовать в регуляции работы сотен белоккодирующихгенов-мишеней. На экспрессию генов микроРНК в свою очередь влияет метилирование CpG-островков. Наша цель состояла в оценке роли метилирования в регуляции экспрессии генов микроРНК и, как следствие, в регуляции экспрессии генов-мишеней в первичных опухолях легкого. С использованием единой коллекции образцов немелкоклеточного рака легкого определен статус метилирования и уровень экспрессии группы генов микроРНК и их потенциальных генов-мишеней RAR-beta2 и NKIRAS1, локализованных на хромосоме 3. Выявлено статистически значимое (Р <= 0.05 по Фишеру) повышение частоты метилирования генов miR-9-l и miR-34b/c в опухолях легкого по сравнению с гистологически нормальной тканью и маргинально значимое (Р <= 0.1) —miR-9-З и miR-193a. Установлена значимая корреляция между изменениями метилирования и уровнем экспрессии гена miR-9-l <Р approx= 5 х 10~(-12)по Спирману>, что позволяет предположить участие метилирования в регуляции экспрессии этого гена микроРНК в опухолях легкого. Кроме того, обнаружена значимая отрицательная корреляция <Р approx= 3 х 10~(-12) —5 х 10~(-13) по Спирману> между изменениями уровней экспрессии miR-9-l и miR-17 и гена-мишени RAR-beta2, и между изменениями уровней экспрессии miR-17и NKIRAS1. Обратная зависимость между уровнями экспрессии генов микроРНК и их генов-мишеней согласуется с известным механизмом подавления экспрессии белоккодирующих генов под действием микроРНК. Впервые определены значимые корреляции (Р approx= 3 х 10~(-10)—4 х 10~(-13) по Спирману> между изменениями метилирования генов микроРНК (miR-9-1, miR-9-3, miR-34b/c, miR-193a) и экспрессией RAR-beta2, а также между изменениями метилирования генов miR-34b/c и miR-193a и уровнем экспрессии NKIRAS1. Эти результаты указывают на возможность опосредованного влияния метилирования генов ряда микроРНК на изменение экспрессии генов-мишеней.