СРАВНЕНИЕ ГЕНОМОВ НОВЫХ ГИГАНТСКИХ ФАГОВ Pseudomonas aeruginosa ИЗ ПРИРОДНЫХ ПОПУЛЯЦИЙ РАЗНЫХ РЕГИОНОВ

摘要

С целью обнаружения отличий в геномах бактериофагов в отдаленных природных популяциях сравнили свойства группы новых гигантских φKZ-иодобных фагов Pseudomonas aeruginosa. выделенных в двух разных регионах, с описанными ранее фагами трех разных видов (φKZ. Lin68, EL). Подтвержден широкий спектр литической активности всех φKZ-подобных фагов. Показано, что наиболее часто в природных популяциях разных регионов встречаются фаги вида φKZ и очень редко -фаги видов EL и Lin68. Большинство фагов вида φKZ обладает уникальным рестрикционным профилем ДНК. но отличия невелики и при этом геномы не содержат негомологичных фрагментов. Для каждого из видов изучавшихся фагов набор капсндных полипептидов очень консервативен и может использоваться как признак, единственный и достаточный для экспресс-классификации фагов до вида. Четких отличий, присущих фагам, выделенным из разных регионов, не обнаружено. Некоторые фаги, обладающие минимальными отличиями в рестрикционном профиле от фага φKZ, могут быть использованы для решения вопроса о происхождении в геноме φKZ генов, кодирующих ортологи - продукты с высоким уровнем сходства с продуктами неродственных видов (других фагов, патогенных бактерий и эукариот).