粗視化モデルを用いたマルチスケールシミュレーションシステムの構築

摘要

生体内では分子·細胞·臓器といったさまざまな時空間スケールでの静的·動的構造が階層的に存在しており，システムとして互いに協調することにより生命象が成り立っている． そのような複雑な生命体システムを計算機手で理解する試みとして，各スケールでの粒子系·ュレーショソや数値モデルによる解析が行われてきた． 最近では，多階層系を連成した「マルチスケール」なシミュレーショソ法が提案され，たとえば，細胞環境の寄与を取り入れた生体分子の振る舞いが研究対象とっている． 本稿では，われわれが研究対象としている生体高分子の全原子くM）レペル，および複数の原子を1自由度でめた粗視化（CG）レべルでの粒子系シミュレーションの連成手法について紹介する．