NMRによるタンパク質とリガンドの相互作用解析

摘要

生物工学的研究において欠かせないのがタンパク質-リガンド間，またはタンパク質-タンパク質間相互作用 の包括的な理解である.多くの実験的手法により相互作用部位の同定と構造解析が可能となってきた.NMRは 分子量が約30 kDa以下の生体高分子の高次構造を解明す る手段として広く認められている.NMRによる相互作 用の研究においてよく用いられるのは化学シフト，緩和 時間，NOEなどである.各NMRシグナルの化学シフ ト値はリガンドの結合に伴う結合部位近傍環境の変化を 敏感に反映する.環境の変化は立体構造に起因するが， 関与する要素が多いため，化学シフト値の変化から直接 立体構造の変化量を導くのは困難である.緩和時間より タンパク質とリガンドの相互作用の動的側面に関する情 報を得ることができる.タンパク質とリガンドが強く結 合している場合，NOEから複合体の立体構造情報を直 接，得ることができる.