БАЗА ДАННЫХ ПО ТОЧНЫМ МАССОВО-ВРЕМЕННЫМ МЕТКАМ ДЛЯ ХРОМАТО-МАСС-СПЕKTРОМЕТРИЧЕСКОГО АНАЛИЗА ПРОТЕОМА МОЧИ

摘要

Информация o белково-пелтидном составе мочи может быть использована для поиска биомаркеров ранних стадий различных заболеваний. Основной методикой идентификации белков и пептидов является тандемная масс-спектрометрия, в которой идентификация осуществляется по масс-спектрам продуктов их фрагментации. Однако наличие стадии фрагментации уменьшает чувствительность анализа и увеличивает его продолжительность. Нами разработан метод определения содержания белков и пептидов в моче человека на основе метода АМТ-меток (точных массово-временных меток) без использования тандемной масс-спект-рометрии. Созданы база данных АМТ-меток, включающая более 1381 АМТ-меток пептидов, и програм-мное обеспечение, позволяющее наполнять базу данных АМТ-меток, нормировать хроматограммы, приме-нять базу для идентификации белков и пептидов и количественной оценки их содержания. Также предложены процедуры идентификации пептидов по масс-хроматограммам по тандемным масс-спектрам и базе АМТ-меток. Приведен список белков, впервые обнаруженных в моче человека.