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Journal of Molecular Modeling

Journal of Molecular Modeling

中文名称：分子建模杂志

ISSN：1610-2940
出版周期：6 issues a year

发文量：1143

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1.The effect of salt concentration on DNA conformation transition: a molecular-dynamics study

机译：盐浓度对DNA构象转变的影响：分子动力学研究
- 作者：Chen Song;Yueyuan Xia;Mingwen Zhao;Xiangdong Liu;Feng Li;Yanju Ji;Boda Huang;Yanyan Yin
- 期刊名称：《Journal of Molecular Modeling》 | 2006年第3期
- DNA conformation transition;
- Molecular dynamics simulation;
- Salt concentration;
- Sugar pucker;
- Minor groove width;
2.Theoretical study of the hydrogen-bonded complexes serotonin–water/hydrogen peroxide

机译：氢键复合体5-羟色胺-水/过氧化氢的理论研究
- 作者：Vassil B. Delchev;Hans Mikosch
- 期刊名称：《Journal of Molecular Modeling》 | 2006年第3期
- Ab initio calculations;
- Density functional calculations;
- Hydrogen-bonds;
- 5-Hydroxy-tryptamine;
- Serotonin;
3.Non-stochastic and stochastic linear indices of the molecular pseudograph’s atom-adjacency matrix: a novel approach for computational in silico screening and “rational” selection of new lead antibacterial agents

机译：分子伪图的原子邻接矩阵的非随机和随机线性指标：一种计算机模拟筛选和“合理”选择新的主要抗菌剂的新颖方法
- 作者：Yovani Marrero-Ponce;Ricardo Medina Marrero;Francisco Torrens;Yamile Martinez;Milagros García Bernal;Vicente Romero Zaldivar;Eduardo A. Castro;Ricardo Grau Abalo
- 期刊名称：《Journal of Molecular Modeling》 | 2006年第3期
4.Molecular modeling of the GABAC receptor ligand-binding domain

机译：GABAC 受体配体结合域的分子模拟
- 作者：Neil J. Harrison;Sarah C.R. Lummis
- 期刊名称：《Journal of Molecular Modeling》 | 2006年第3期
- GABAρ receptor;
- Rho receptor;
- Ligand-gated ion channel;
- Cys-loop receptor;
- Neurotransmitter binding site;
- Ligand docking;
5.Model of the whole rat AT1 receptor and the ligand-binding site

机译：整个大鼠AT1 受体的模型及其配体结合位点
- 作者：Camelia Baleanu-Gogonea;Sadashiva Karnik
- 期刊名称：《Journal of Molecular Modeling》 | 2006年第3期
- AT1 receptor;
- Ang II;
- GPCR model;
- Molecular dynamics simulation;
- Docking;
6.Prediction of β-strand packing interactions using the signature product

机译：使用特征积预测β链堆积相互作用
- 作者：W. Michael Brown;Shawn Martin;Joseph P. Chabarek;Charlie Strauss;Jean-Loup Faulon
- 期刊名称：《Journal of Molecular Modeling》 | 2006年第3期
- β-sheets;
- Secondary structure prediction;
- Signature descriptor;
- Support vector machine;
7.Application of artificial neural networks for predicting the aqueous acidity of various phenols using QSAR

机译：人工神经网络在QSAR预测各种苯酚水溶液酸度中的应用
- 作者：Aziz Habibi-Yangjeh;Mohammad Danandeh-Jenagharad;Mahdi Nooshyar
- 期刊名称：《Journal of Molecular Modeling》 | 2006年第3期
8.Prediction of toxicity using a novel RBF neural network training methodology

机译：使用新型RBF神经网络训练方法预测毒性
- 作者：Georgia Melagraki;Antreas Afantitis;Kalliopi Makridima;Haralambos Sarimveis;Olga Igglessi-Markopoulou
- 期刊名称：《Journal of Molecular Modeling》 | 2006年第3期
- RBF architecture;
- Neural network;
- QSTR;
- Toxicity;
- Tetrahymena pyriformis;
9.AMBER force-field parameters for phosphorylated amino acids in different protonation states: phosphoserine, phosphothreonine, phosphotyrosine, and phosphohistidine

机译：不同质子化状态下磷酸化氨基酸的AMBER力场参数：磷酸丝氨酸，磷酸苏氨酸，磷酸酪氨酸和磷酸组氨酸
- 作者：Nadine Homeyer;Anselm H. C. Horn;Harald Lanig;Heinrich Sticht
- 期刊名称：《Journal of Molecular Modeling》 | 2006年第3期
- AMBER;
- Parameters;
- Phosphorylated amino acids;
- Force field;
- Restrained electrostatic potential;
10.Acetylcholine nicotinic receptors: finding the putative binding site of allosteric modulators using the “blind docking” approach

机译：乙酰胆碱的烟碱受体：使用“盲对接”方法寻找变构调节剂的推定结合位点
- 作者：Bogdan Iorga;Denyse Herlem;Elvina Barré;Catherine Guillou
- 期刊名称：《Journal of Molecular Modeling》 | 2006年第3期
- Allosteric modulators;
- Acetylcholine nicotinic receptors;
- Docking;
11.Ab initio and DFT study on the electrophilic addition of bromine to endo-tricyclo[3.2.1.02,4]oct-6-ene

机译：从头算和DFT研究内三环[3.2.1.02,4 ] oct-6-ene亲电子加成溴
- 作者：Rza Abbasoglu;Sevil Savaskan Yilmaz
- 期刊名称：《Journal of Molecular Modeling》 | 2006年第3期
- Ab initio and DFT calculations;
- Molecular complexes;
- Nonclassical cation;
- Pyramidalization;
- Endo-tricyclo3.2.1.02;
- 4oct-6-ene;
12.Molecular docking study on the “back door” hypothesis for product clearance in acetylcholinesterase

机译：乙酰胆碱酯酶产物清除的“后门”假设的分子对接研究
- 作者：Laleh Alisaraie;Gregor Fels
- 期刊名称：《Journal of Molecular Modeling》 | 2006年第3期
- Back door;
- AchE;
- Molecular docking;
- Mf268;
- Eseroline;
13.HIV-1 GP120 V3 conformational and informational entropies

机译：HIV-1 GP120 V3构象和信息熵
- 作者：Joel K. Weltman;Gail Skowron;George B. Loriot
- 期刊名称：《Journal of Molecular Modeling》 | 2006年第3期
- HIV-1;
- V3 loop;
- GP120;
- HF-SCF;
- Entropy;
- Energy;
- Conformational entropy;
- Informational entropy;
- Shannon entropy;
- Entropy variance;
- Molecular evolution;
14.Ab initio and DFT study on the electrophilic addition of bromine to endo-tricyclo3.2.1.0(2,4)oct-6-ene

机译：溴在内三环3.2.1.0（2,4）辛-6-烯中的亲电加成从头和DFT研究
- 作者：Abbasoglu R;Yilmaz SS
- 期刊名称：《Journal of molecular modeling》 | 2006年第3期
15.QSTR with extended topochemical atom (ETA) indices. VI. Acute toxicity of benzene derivatives to tadpoles (Rana japonica)

机译：具有扩展的拓扑化学原子（ETA）指数的QSTR。 VI。苯衍生物对t的急性毒性
- 作者：Kunal Roy;Gopinath Ghosh
- 期刊名称：《Journal of Molecular Modeling》 | 2006年第3期
- QSTR;
- QSAR;
- ETA;
- TAU;
- VEM;
- Factor analysis;
- Genetic function approximation;
16.Prediction of beta-strand packing interactions using the signature product

机译：使用特征产物预测 β-链堆积相互作用
- 作者：Brown WM;Martin S;Chabarek JPStrauss CFaulon JL
- 期刊名称：《Journal of molecular modeling》 | 2006年第3期

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