摘要:为比较柔嫩艾美球虫(Eimeriatene lla)与鸡的组蛋白去乙酰化酶3(Histone Deacetylase 3,HDAC3)蛋白质序列和结构差异,以发现和筛选E.tenella HDAC3 (EtHDAC3)的特异性抑制物,应用RT-PCR方法从杂交黄羽肉鸡的肠上皮细胞克隆ChHDAC3基因,以原核表达载体pMAL-C2X构建重组质粒pMAL-C2X-ChHDAC3,经双酶切和测序鉴定后转化E.colitransetta,进行IPTG诱导表达.使用Swiss-Model对ChHDAC3和EtHDAC3进行同源模建,比较分析ChHDAC3和EtHDAC3的活性位点.利用Autodock 4.2进行分子对接,研究抑制剂Apicidin与ChHDAC3、EtHDAC3结合模式的差异.结果显示,克隆的ChHDAC3基因ORF由1287个核苷酸组成,编码428个氨基酸,能在大肠杆菌中进行可溶性表达.构建的ChHDAC3和EtHDAC3的三维模型显示其均由八个串联的β折叠和11个α螺旋组成,其活性位点高度保守,仅在表面识别区的有一个氨基酸的差异.分子对接分析结果显示,Apicidin与EtHDAC3有更低的结合能,提示Apicidin对EtHDAC3具有更强的抑制活性和选择性.