次世代シーケンサ一を適用した ダム湖の微生物生態系解析

摘要

湖沼の微生物生態系解析に次世代シーケンサーが適用されるようになり，さまざまな報告がなされている。われわれは，1年間にわたって16S rRNA遺伝子アンプリコンシーケ ンシングにより宮ケ瀬湖の表層，中層，底層について真正細菌，古細菌をターゲットとし た微生物相解析を行なった。その結果，表層と中層で微生物相が大きく異なることが明ら かとなつた。属レベルで評価すると表層，中層，底層に共通してActinobacteria綱 Sporichthyaceae科hgc I cladeの割合が最も高かった。三層に共通して出現する微生物， 表層にのみ出現する微生物，中層および底層に出現する微生物の存在が明らかとなった。 本手法は，湖沼の微生物生態系を解析するうえできわめて有効であると考えられた。