大量処理型BioMEMS DNAシーケンサ　DeNOVA-5000HTの開発

摘要

本稿において著者らは，サンガ一法にもとづく，384本流路の大型BioMEMS（Bio Micro Electro MechanicalrnSystem）キヤピラリープレートを用いた新たなDNAシーケンサを細介する。二枚のキヤピラリープレートをrn用いて並列処理を行うことで，分析時間の短縮が可能となった。また，分子ふるいポリマー充填機構，192ノrnズルのピペッター，48ノズルのアスビレータ，サンプルスタッカや4色蛍光法によるレーザ励起スキャナによrnり，24時間無人運転が可能である。この新たなシーケンシング·プラットフォームに，P3e分子ふるいポリマrnーと新たなべースコーラを適用することで，99%の正答率で平均1018塩基の長銀解読を可能にし，その塩基配列決定量は5百万塩基/日を実現する。%Here we present the new DNA sequencer based on Sanger chemistry in which the large-scale BioMEMS capillary plate with 384 channels is applied. A parallel processing enables to shorten the analysis cycle time utilizing two capillary plates. 24H walk-away automation is achieved by sieving polymer refilling system, 192-nozzle pipetter, 48-nozzle aspirator, sample MTP stacker, and laser-induced scanner with four color detection system. Applying P3e sieving polymer and newly developed base-calling software to this new sequencing platform, it enables to obtain long-read sequencing data of the average read length of 1,018 bases at 99% accuracy, and the throughput reaches 5 Mbp per day per instrument.