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NBS/2DE/MS法による薬剤応答性乳癌タンパク質マーカの探索

机译:通过NBS / 2DE / MS方法搜索对药物敏感的乳腺癌蛋白标记

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摘要

疾患における薬剤応答性タンパク質マーカの発見は,その治療や予後にきわめて重要である。著者らは,乳rn癌細胞のモデルとしてエストロゲン受容体陽性(ER+)のセルラインMCF-7を用い,これを乳癌治療薬タモrnキシフェン(TAM)で処理した時に発現が変動するタンパク質を島津製作所が開発した定量的プロテオーム解rn析試薬NBSClと2DE/MSを組み合わせる方法により解析し,有益なる知見を得た。TAM処理と非処理の比較rnにおいて88個のスポットが明らかな発現差を示した。このうち44個は質量差6DaのNBSラベル化ペアペプチrnドとして同定でき,23種の異なるタンパク質が含まれていた。そのうち16個(70%)は,TAM処理やER活性rnとの関連が明らかにされていない。これらのタンパク質のうち,GRP78,CK19,PA2G4について生物学的評rn価として免疫プロット法による確認,続いてPA2G4については免疫組織化学染色法による評価を行った。さらrnにこのPA2G4については,対応する遺伝子発現と乳癌再発との関係を調べるため,二つの独立した乳癌患者集rn団のmRNAおよび予後に関するデータを使用して検討した結果,新しい予後診断因子になりえる可能性を見rn出した。以上の結果,NBS試薬と2DE/MSを組み合わせた解析手法は非常に有効な方法であるといえる。%The identification of drug-responsive protein biomarkers for disease is crucial to its medical treatment and prognosis. The present paper describes a novel approach for identifying drug-induced protein alternations, for which NBSC1 tryptophan labeling reagent developed by Shimadzu and 2DE/MS were combined. As a sample model, the estrogen positive breast cancer cell line MCF-7 was used. For comparative study, half of the cultured cells were treated by Tamoxifen (TAM) and the other half were not treated as control group. Of 88 protein spots that showed significant difference in expression between TAM treatment and non-treatment, 44, including 23 distinct protein species, were identified as NBS-labeled pair peptide with a mass difference of 6Da. Of the 23 TAM-treated proteins, 16 (i.e., 70%) have not been clarified concerning relationship to TAM or ER activity. To validate the NBS/2DE/MS results, GRP78, CK19 and PA2G4 proteins were selected and confirmed using the immunoblotting method. Then, PA2G4 was validated by the immuno-tissue-microarray analysis method. Furthermore, the relationship between gene expression and breast cancer recurrence was studied for PA2G4, where database on mRNA expression and disease-free survival in two independent breast cancer patient cohorts was utilized. The study findings suggest that PA2G4 has a possibility of becoming a novel prognosis factor for disease-free survival. Considering all the results obtained in this search, we can conclude that the combination of NBS and 2DE/MS is a very useful tool for research of protein markers.
机译:在疾病中发现药物反应性蛋白标志物对于其治疗和预后极为重要。作者使用雌激素受体阳性(ER +)细胞系MCF-7作为乳腺癌细胞模型,并鉴定了用乳腺癌药物他莫昔芬(TAM)处理后其表达会发生波动的蛋白质。作者开发的定量蛋白质组裂解试剂NBSCl和2DE / MS用于分析,并获得了有用的信息。 88个斑点在Trn处理和未处理的rn中显示出明显的差异。其中有44种可以鉴定为NBS标记的成对肽,质量差为6 Da,其中包含23种不同的蛋白质。未显示其中有16个(70%)与TAM治疗或ER活性相关。在这些蛋白质中,通过免疫印迹确认了GRP78,CK19和PA2G4作为生物学评价值,然后通过免疫组织化学染色评价了PA2G4。此外,利用两名独立乳腺癌患者的mRNA数据和预后来研究该PA2G4,以研究相应的基因表达与乳腺癌复发之间的关系,并使其成为一种新的预后因素。我发现了可能性。从以上结果可以说,结合NBS试剂和2DE / MS的分析方法是一种非常有效的方法。疾病的药物反应蛋白生物标志物的鉴定对于其医学治疗和预后至关重要。本文介绍了一种鉴定药物诱导的蛋白变化的新方法,将Shimadzu开发的NBSC1色氨酸标记试剂与2DE / MS结合使用。为了进行比较,将一半的培养细胞用他莫昔芬(TAM)处理,另一半不作为对照组,共88个蛋白点用于比较研究。在TAM处理和未处理之间表达差异显着的44种,包括23种不同的蛋白质,被鉴定为NBS标记的配对肽,质量差为6Da。在23种经过TAM处理的蛋白质中,有16种(即70种)关于TAM或ER活性的关系尚未明确。%为了验证NBS / 2DE / MS结果,选择了GRP78,CK19和PA2G4蛋白并使用免疫印迹法进行了确认。然后,通过免疫组织微阵列分析方法对PA2G4进行了验证。不同的是,研究了PA2G4的基因表达与乳腺癌复发的关系,利用两个独立的乳腺癌患者队列的mRNA表达和无病生存期数据库。研究结果表明PA2G4有可能成为无病生存的一种新的预后因素。考虑到本次研究获得的所有结果,我们可以得出结论,NBS和2DE / MS的组合是一种非常有用的研究工具。蛋白质标记。

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