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無相関入力によりサブネットワークに生成する相関

机译:不相关输入在子网中生成的相关性

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摘要

少数ノードから構成されるサブプーリアンネットワークの動作特性解析法を提案する.具体的には,3ノードから構成される12種のサブネットワークに数値的にランダムで無相関な2進列を入力状態として与え,各ノードからの出力状態を求めた.この出力状態から出力確率,エントロピー,ノード間の出力相関(相互情報量)を求め,サブネットワークの入出力特性とした.これらの特性は,サブネットワークの構造とノードに対するプール関数の配置に依存して変化した.本方法によりサブネットワークの構造と動的な性質の関係を知ることができる.全てのプール関数の配置の組み合わせの平均値から,そのサブネットワークにおける平均的な特性を求めることができ,その結果から,12種のサブネットワークにおいて平均出力確率は全て同じであり,エントロピーには大差はなかったが,相互情報量はサブネットワーク構造に強く依存した.特に分岐構造を内在するサブネットワークにおいて,大きい相互情報量が得られた.これらの結果は,遺伝子重複がネットワークの進化において重要であることと一貫性がある.%We propose an analyzing and comparing method for 12 different sub-Boolean networks that have three nodes. By applying random and uncorrelated binary external inputs to the 3-node sub-Boolean networks we obtained networks' dynamic characteristics from the output states from the nodes. Size of entropy and degree of correlations between outputs(mutual information) are also obtained from the states. The dynamic characteristics are sensitive to both subnetwork structures and Boolean function assignments to node. The characteristics provide useful insight into understanding of relationships between dynamics of subnetworks and their structures. Average output probabilites of 12 sub-Boolean networks are equal after averaging all possible combinations of Boolean functions. Sizes of entropy show the same order in different sub-Boolean networks. However sizes of mutual information strongly depends on the network structures that commonly share divergent structure, is consistent with an importance of gene duplications in evolutionary processes of gene networks.
机译:我们提出了一种用于分析由少量节点组成的亚普利亚网络的运行特性的方法。具体地,将数字随机且不相关的二进制序列作为输入状态给出给由3个节点组成的12种类型的子网,并且获得来自每个节点的输出状态。从该输出状态获得节点之间的输出概率,熵和输出相关性(互信息),并将其用作子网的输入/输出特性。这些特性根据子网结构和池功能相对于节点的位置而变化。通过这种方法,可以知道子网的结构和动态特性之间的关系。从所有池函数的排列组合的平均值中可以得到子网络的平均特征,从结果可以看出,这12种子网络的平均输出概率是相同的,其熵也相差很大。但是,相互信息在很大程度上取决于子网结构。特别地,在具有分支结构的子网中获得了大量的互信息。这些结果与基因复制在网络进化中的重要性一致。我们针对12个具有三个节点的不同子布尔网络提出了一种分析和比较方法,通过将随机且不相关的二进制外部输入应用于3节点子布尔网络,我们从节点的输出状态中获得了网络的动态特性还可以从状态中获得熵的大小和输出(相互信息)之间的相关程度。动态特性对子网结构和节点的布尔函数分配都很敏感,这些特性有助于理解子网动态之间的关系。在对布尔函数的所有可能组合求平均后,12个布尔布尔网络的平均输出概率相等。在不同的布尔布尔网络中,熵的大小显示相同的顺序,但是互信息的大小很大程度上取决于网络结构共同的股份结构不同,很重要基因网络进化过程中的基因复制研究。

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