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机译:Bactag - 一种基于数据库预处理的细菌测序数据的快速和准确基因和等位基因的管道
Nextgeneration sequencingMultilocus sequence typingDatabase preprocessingAllele typing;
机译:下一代测序可以揭示体外产生的PCR交叉产物:一些人为序列对应于IMGT / HLA数据库中的HLA等位基因
机译:扩展IMGT / HLA数据库:全基因测序为247个不同的HLA-DPB1等位基因
机译:扩展IMGT / HLA数据库:全基因测序为247个不同的HLA-DPB1等位基因
机译:用于来自下一代测序数据的转换元件的超快速和可伸缩的量化流水线
机译:通过训练数据集预处理创建快速而准确的机器学习集合。
机译:BacTag-基于数据库预处理在细菌测序数据中快速准确地输入基因和等位基因的管道
机译:细菌鉴定和抗菌药敏试验通常是手动进行的。最近,样品的数量增加了,并且对自动化的需求也在增长。 BioMerieux为此进行了Vitek2的研究。 HUSLAB已指派我们比较常规方法和Vitek2的鉴定和抗菌结果。此外,我们还评估了测试反应,ESBL(扩展频谱β-内酰胺酶)的产生以及使用Vitek2获得结果所需的时间。在这项研究中,我们检查了总共183个细菌分离株,包括76个ESBL菌株,40个非发酵棒,41个营养细菌和26个新鲜临床分离株。从患者数据库中收集常规方法的结果,然后将其与Vitek2给出的结果进行比较。 Vitek2正确鉴定出超过96种ESBL菌株和新鲜的临床分离株。与常规方法相比,非发酵棒和精制细菌的结果为70。 Api20E的测试反应结果与Vitek2结果一致为94nd Api20NE 70 n。所有Vitek2抗菌结果约80 f和ESBL测试结果90 f正确。与早期的研究相比,Vitek2的测试速度快于常规方法。这些结果表明Vitek2能够给出快速而准确的结果。但是,应进一步研究非发酵棒和营养细菌。