EVALUATION OF DIFFERENT TECHNIQUES FOR DNA DIRECT EXTRACTION FROM BRAZILIAN AGRICULTURAL SOIL

摘要

O solo é um ecossistema caracterizado pela sua grande complexidade e heterogeneidade, que o torna de difícil estudo, especialmente em rela??o à sua comunidade microbiana. Atualmente, ferramentas da biologia molecular têm sido utilizadas para o estudo de biodiversidade e descoberta de novas espécies, principalmente por meio da avalia??o dos genes microbianos. A extra??o direta do DNA do solo é um importante passo nesse tipo de estudo, porém a maioria das técnicas desenvolvidas é aplicada para solos de clima temperado e poucos estudos têm sido feitos para o desenvolvimento de métodos para aplica??o em solos brasileiros. Por esse motivo, este trabalho teve como objetivo avaliar nove diferentes técnicas para extra??o direta de DNA de solo sob cultura de cana-de-a?úcar, em cultivo organico e convencional e propor modifica??es que resultem maior rendimento de DNA e menor custo. Bandas de DNA foram observadas somente com três técnicas (Selbach, Direito e kit comercial), duas delas já testadas anteriormente para solos tropicais. Os melhores resultados quanto ao rendimento em DNA (μg.g-1 solo) foram obtidos com os protocolos de Selbach e do kit comercial, porém estes resultados n?o diferiram estatisticamente daqueles obtidos com o protocolo aqui criado e proposto. Os melhores rendimentos em DNA foram encontrados em solo sob cultivo organico provavelmente devido à maior biomassa microbiana. O protocolo proposto apresentou melhores resultados em rendimento de DNA independentemente do solo utilizado e mostrou-se de mais fácil execu??o e de menor custo.