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【24h】

Genotipificación por VNTR de aislados de Mycobacterium bovis de ganado sacrificado en Baja California, México

机译:墨西哥下加利福尼亚州屠宰牛的牛分枝杆菌的VNTR基因分型

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摘要

>En México, la tuberculosis bovina (TBB) es uno de los principales problemas que enfrenta la ganadería nacional. Las diferentes técnicas de genotipificación pueden ayudar a establecer la relación que existe entre las diferentes cepas presentes en una región y determinar algunos factores que incidan posteriormente en los programas de control y erradicación de la enfermedad. En el presente trabajo se aplicó la técnica de número variable de repeticiones en secuencia (VNTR) a 11 aislados provenientes de ganado sacrificado en un rastro de Mexicali BC, y a 10 aislados de ganado sacrificado en un rastro de Tijuana. Se utilizaron oligonucleótidos específicos para amplificar los loci ETR-A, ETR-B, QUB-11a, QUB-11b, QUB-1895, QUB-26, QUB-3232 y QUB-3336, determinándose el parentesco relativo entre las cepas aisladas, así como el poder discriminatorio para cada locus en particular y para todos los loci en su conjunto. Se obtuvieron 14 perfiles alélicos al utilizar los ocho loci con un poder discriminatorio de 0.90 siendo el locus QUB 3336 el que mostró el mayor poder discriminatorio (h=0.72) en tanto el locus ETR-B mostró un nulo poder discriminatorio (h=0.00). En un dendrograma, se observaron seis grupos genéticos, en los cuales se encuentran indistintamente aislados de Tijuana y Mexicali Baja California; sin embargo, se encontraron genotipos específicos para cada una de las dos regiones. Los resultados sugieren que aunque el movimiento de ganado y la compra-venta en la región han provocado la dispersión de cepas en estas dos áreas, se puede discernir el origen de la mayoría de los aislados.
机译:>在墨西哥,牛结核病(TBB)是本国牲畜面临的主要问题之一。不同的基因分型技术可以帮助建立区域中存在的不同菌株之间的关系,并确定一些随后影响疾病控制和根除计划的因素。在目前的工作中,可变重复序列的技术(VNTR)被应用于不列颠哥伦比亚省墨西卡利市一个屠宰场中的11头牛,以及蒂华纳州一个屠宰场中的10头牛。使用特定的寡核苷酸扩增ETR-A,ETR-B,QUB-11a,QUB-11b,QUB-1895,QUB-26,QUB-3232和QUB-3336位点,从而确定分离菌株之间的相对亲缘关系,从而尤其是每个基因座以及整个基因座的歧视能力。当使用具有0.90的鉴别力的八个基因座时,获得了14个等位基因谱,其中QUB 3336位点显示出最高的鉴别力(h = 0.72),而ETR-B位点显示出无效的鉴别力(h = 0.00) 。在树状图中,观察到六个基因组,它们是从蒂华纳州和墨西卡利下加利福尼亚州模糊地分离的;然而,发现了两个区域中每个区域的特定基因型。结果表明,尽管该地区的牲畜流动和买卖造成了这两个地区的菌株扩散,但大多数分离株的起源还是可以辨别的。

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