VNTR在陕西省耐药结核分枝杆菌基因分型中的研究

摘要

目的 了解陕西省89例耐药结核分枝杆菌多位点数目可变串联重复序列分析(VNTR)的基因多态性及近期传播情况.方法 选取陕西省10个地市结核分枝杆菌耐药菌株89株,提取基因组DNA,采用聚合酶反应(PCR)对15个VNTR位点进行检测分析,基因分型聚类分析采用Bio-Numerics5.0软件.结果 经基因聚类分析.可分4个基因群(I群、Ⅱ群、Ⅲ群和Ⅳ群),为4种基因群分别占7.87％(7/89)、3.37％(3/89)、87.64％(78/89)、1.12％(1/89).成簇率为4.49％(4/89);近期感染率最小估计为2.25％(2/89).15个VNTR位点中有4个位点的多态性较好(h>0.60),5个位点的多态性尚可(0.3≤h≤0.6),6个位点的多态性较差(h<0.3).结论 初步证实陕西省耐药结核分枝杆菌菌株存在明显的基因多态性,其主要流行型为Ⅲ群.