Triagem e análise da express?o diferencial dos genes entre melancia diplóide e autotetraplóide através do perfil de express?o gênica digital

摘要

Resumo Poliploides sintéticos s?o materias fundamentais para melhoramento genético da melancia. Comparativamente ao seu homólogo diploide, a melancia tetraploide apresenta amplas diferen?as genotípica e fenotípica e diferen?a de express?o gênica. A express?o gênica digital ou DGE (digital gene expression) foi utilizada neste estudo para representar o perfil de express?o gênica da melancia autotetraploide e seu progenitor diploide e a express?o diferencial de genes relacionados ao estresse biótico e abiótico. Os resultados mostraram que 4.985 DEGs foram observados no organismo autotetraploide, sendo que, deste total, 66.02%foram supra-regulados. A análise de ontologia gênica (GO) mostrou que estes DEGs est?o relacionados principalmente com processos metabólicas, célula e atividade catalítica, abrangendo de acordo com a análise de genes e genoma (KEGG) rotas metabólicas, metabolismo secundário e ribossomos. Além disso, 134 genes de defesa foram identificados, abrangendo substancias de ajuste osmótico, enzimas/proteínas de prote??o, proteínas sinalizadoras e proteínas relacionadas à patogênese. Este estudo mostrou a express?o diferencial de genes relacionados ao estresse e o perfil global de express?o gênica de melancia autotetraploide, estes resultados podem complementar, a nível molecular, o entendimento do fator resistência após a duplica??o do genoma em cucurbitáceas.