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Genome Data of Fusarium oxysporum f. sp. cubense Race 1 and Tropical Race 4 Isolates Using Long-Read Sequencing

机译:尖孢镰刀菌基因组数据sp。使用长读测序对多维数据集种族1和热带种族4进行隔离

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摘要

Fusarium wilt of banana is caused by the soilborne fungal pathogen Fusarium oxysporum f. sp. cubense. We generated two chromosome-level assemblies of F. oxysporum f. sp. cubense race 1 and tropical race 4 strains using single-molecule real-time sequencing. The F. oxysporum f. sp. cubense race 1 and tropical race 4 assemblies had 35 and 29 contigs with contig N50 lengths of 2.08 and 4.28 Mb, respectively. These two new references genomes represent a greater than 100-fold improvement over the contig N50 statistics of the previous short-read-based F. oxysporum f. sp. cubense assemblies. The two high-quality assemblies reported here will be a valuable resource for the comparative analysis of F. oxysporum f. sp. cubense races at the pathogenic level.
机译:香蕉枯萎病是由土壤传播的真菌病原菌Fusarium oxysporum f引起的。 sp。立方。我们生成了F. oxysporum f。的两个染色体水平的程序集。 sp。使用单分子实时测序的立方菌种1和热带菌种4菌株。 F.oxysporum f。 sp。立方体1族和热带4族的装配体分别具有35个和29个重叠群,其重叠群N50长度分别为2.08和4.28 Mb。这两个新的参考基因组比以前的基于短读的尖孢镰刀菌f。的重叠群N50统计数据代表了大于100倍的改进。 sp。立方体装配体。这里报告的两个高质量的程序集将是比较分析F. oxysporum f。的宝贵资源。 sp。立方体种族在致病性水平。

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