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Variabilidad genética en regiones codificantes del antígeno de superficie y el dominio de la transcriptasa inversa de la polimerasa del virus de la hepatitis B, Colombia, 2002-2014

机译:乙型肝炎病毒聚合酶表面抗原和逆转录酶结构域编码区的遗传变异,哥伦比亚,2002-2014年

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摘要

Resumen Introducción. Se estima que 240 millones de personas en el mundo tienen infección crónica con el virus de la hepatitis B (HBV). En Colombia, la endemia es variable y circulan diferentes genotipos virales. Las mutaciones a lo largo del genoma se han asociado con resistencia antiviral, el escape ante la reacción de anticuerpos neutralizadores tras la vacunación o a la infección natural, la infección oculta y la progresión a carcinoma hepatocelular. Objetivo. Identificar los genotipos y las mutaciones presentes en la región codificante del antígeno de superficie (S) y del dominio de la transcriptasa inversa (reverse transcriptase, RT) de la polimerasa del HBV en muestras de suero remitidas al Instituto Nacional de Salud de Colombia para el diagnóstico de hepatitis B, entre el 2002 y el 2014. Materiales y métodos. En 495 muestras de suero positivas para el antígeno de superficie de la hepatitis B (HBsAg) se buscó el ADN viral, se amplificó y secuenció un fragmento de 1.591 nucleótidos y, posteriormente, se hizo el análisis filogenético correspondiente. Resultados. En 66 de las muestras se logró detectar el genoma viral y 28 de ellas se secuenciaron exitosamente. El análisis filogenético permitió identificar los genotipos y subgenotipos F3 y A2. Una muestra presentó simultáneamente las sustituciones de resistencia L180M y M204V, otra presentó la sustitución I169L y en una se identificó la mutación P120Q, previamente asociada con variantes de escape. Dos muestras presentaron una deleción de 105 nucleótidos en la región preS1-preS2. Conclusiones. Se corroboró la circulación en Colombia de los genotipos y subgenotipos F3 y A2, así como la presencia de mutaciones de resistencia y escape. El presente estudio constituye un aporte a la epidemiologia molecular del HBV en Colombia.
机译:摘要介绍。全世界估计有2.4亿人长期感染了乙型肝炎病毒(HBV)。在哥伦比亚,流行性是可变的,并且有不同的病毒基因型在流通。整个基因组中的突变与抗病毒抗性相关,在疫苗接种或自然感染,隐匿性感染以及进展为肝细胞癌后逃避中和抗体反应。目的。确定存在于表面抗原(S)编码区中的基因型和突变,以及送至哥伦比亚国立卫生研究院(National Institute of Health)的血清样本中HBV聚合酶的逆转录酶(reverse transcriptase,RT)域。 2002年至2014年间诊断为乙型肝炎。材料和方法。在495份乙型肝炎表面抗原(HBsAg)阳性的血清样本中,搜索了病毒DNA,扩增了1,591个核苷酸片段并测序,随后进行了相应的系统发育分析。结果。在66个样本中,检测到病毒基因组并成功测序了28个。系统发育分析可以确定F3和A2基因型和亚基因型。一个样品同时显示了L180M和M204V抗性替换,另一个样品显示了I169L替换,其中一个标识了先前与逃避变异相关的P120Q突变。两个样品在preS1-preS2区域中缺失了105个核苷酸。结论。证实了哥伦比亚的F3和A2基因型和亚基因型流通,以及耐药性和逃避突变的存在。本研究对哥伦比亚的乙肝病毒分子流行病学做出了贡献。

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