Intérêt de la spectrométrie de masse MALDI-TOF pour l’identification des levures. Évaluation et utilisation en routine hospitalière à Dijon et à Lille

摘要

L’identification conventionnelle (IC) des levures est fondée sur l’utilisation des tests morphologiques, immunologiques et biochimiques (galerie API® 32 C, bioMérieux). La spectrométrie de masse MALDI-TOF (SM) a été proposée récemment comme nouvelle approche pour l’identification des microorganismes. L’objectif de notre étude était de comparer prospectivement les performances analytiques de la SM et de l’IC pour l’identification des isolats cliniques de levures. En cas de discordance d’identification, le séquençage des régions ITS de l’ADN ribosomal était utilisé comme méthode d’identification de référence. Un total de 1 207 souches a été analysé. Une concordance entre SM et IC a été observée pour 1 105 souches (91,5 %) alors que la proportion de souches différemment identifiées par IC et SM n’était que de 6,1 % (74 souches). Parmi ces 74 identifications discordantes entre SM, l’identification par biologie moléculaire confirmait l’identification obtenue par SM pour 73 isolats (6 %) et celle obtenue par IC pour 1 isolat (0,1 %). Pour les principales espèces d’intérêt médical, les concordances d’identification entre les deux techniques étaient excellentes (entre 98 et 100 %) y compris pour les espèces phylogénétiquement proches (Candida albicans/Candida dubliniensis; Candida inconspicua/Candida norvegensis; Candida parapsilosis/Candida metapsilosis/Candida orthopsilosis). La SM n’a été mise en défaut que pour 2,3 % des souches appar tenant aux espèces Candida famata, Candida lambica, Candida magnoliae et aux genres Geotrichum sp. et Trichosporon sp. Nos investigations soulignent le potentiel de la SM pour l’identification des levures et comme alternative fiable, rapide et de moindre coût par rapport aux méthodes conventionnelles.