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Application of Approximate Pattern Matching in Two Dimensional Spaces to Grid Layout for Biochemical Network Maps

机译:二维空间近似模式匹配在生化网络图网格布局中的应用

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摘要

BackgroundFor visualizing large-scale biochemical network maps, it is important to calculate the coordinates of molecular nodes quickly and to enhance the understanding or traceability of them. The grid layout is effective in drawing compact, orderly, balanced network maps with node label spaces, but existing grid layout algorithms often require a high computational cost because they have to consider complicated positional constraints through the entire optimization process.
机译:背景对于可视化大规模生化网络图,重要的是快速计算分子节点的坐标并增强对它们的理解或可追溯性。网格布局可有效绘制带有节点标签空间的紧凑,有序,平衡的网络地图,但是现有的网格布局算法通常需要较高的计算成本,因为它们必须在整个优化过程中考虑复杂的位置约束。

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