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The TREC 2004 genomics track categorization task: classifying full text biomedical documents

机译:TREC 2004基因组学跟踪分类任务:对全文生物医学文献进行分类

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摘要

BackgroundThe TREC 2004 Genomics Track focused on applying information retrieval and text mining techniques to improve the use of genomic information in biomedicine. The Genomics Track consisted of two main tasks, ad hoc retrieval and document categorization. In this paper, we describe the categorization task, which focused on the classification of full-text documents, simulating the task of curators of the Mouse Genome Informatics (MGI) system and consisting of three subtasks. One subtask of the categorization task required the triage of articles likely to have experimental evidence warranting the assignment of GO terms, while the other two subtasks were concerned with the assignment of the three top-level GO categories to each paper containing evidence for these categories.
机译:背景TREC 2004基因组学专题会议着重于应用信息检索和文本挖掘技术来改善基因组信息在生物医学中的使用。基因组学轨道包括两个主要任务,即席检索和文档分类。在本文中,我们描述了分类任务,该任务着重于全文文档的分类,模拟了鼠标基因组信息学(MGI)系统的策展人的任务,该任务由三个子任务组成。归类任务的一个子任务需要对可能具有实验证据以保证GO术语分配的文章进行分类,而其他两个子任务则涉及将三个顶级GO类别分配给每篇包含这些类别证据的论文。

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