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Characterization of the complete chloroplast genome of Sanming wild banana (Musa itinerans) and phylogenetic relationships

机译:三明野生香蕉(Musa Itinerans)和系统发育关系完全叶绿体基因组的特征

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摘要

Sanming wild banana (Musa itinerans) is a cold resistant wild banana found in Fujian province of China. In this study, we characterized its complete chloroplast genome using BGISEQ-500 sequencing. The chloroplast genome is 171,815 bp in size, containing a pair of IR regions (35,142 bp), a large single copy region (89,995 bp), and a small single copy region (11,464 bp). The whole chloroplast genome contains 111 unique genes, including 78 protein-coding genes, 29 tRNAs, and 4 rRNAs. Phylogenetic maximum likelihood analysis revealed that Sanming wild banana showed the closest relationship with Musa itinerans that collected from Yunnan Province of China.
机译:Sanming Wild Banana(Musa Itinerans)是福建省福建省的耐寒野生香蕉。在这项研究中,我们使用BGiseQ-500测序表征了其完全叶绿体基因组。叶绿体基因组的尺寸为171,815bp,含有一对红外区域(35,142bp),大单拷贝区域(89,995bp)和小单拷贝区域(11,464bp)。整个叶绿体基因组含有111个独特的基因,包括78个蛋白质编码基因,29个TrNA和4 rRNA。系统发育最大似然分析显示,Sanming Wild Banana与来自中国云南省收集的Musa Itinerans最接近的关系。

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