首页> 美国卫生研究院文献>BMC Bioinformatics >pmTM-align: scalable pairwise and multiple structure alignment with Apache Spark and OpenMP

【2h】

pmTM-align: scalable pairwise and multiple structure alignment with Apache Spark and OpenMP

机译：PMTM-align：可扩展的成对和与Apache Spark和OpenMP的多个结构对齐

代理获取

本网站仅为用户提供外文OA文献查询和代理获取服务，本网站没有原文。下单后我们将采用程序或人工为您竭诚获取高质量的原文，但由于OA文献来源多样且变更频繁，仍可能出现获取不到、文献不完整或与标题不符等情况，如果获取不到我们将提供退款服务。请知悉。

页面导航

摘要
著录项
相似文献
相关主题

摘要

The two-stage design of pmTM-align. In stage 1, pairwise structure alignments (PSAs) are achieved on a Spark cluster. Next, another script was used to collect results from HDFS and then send to a local program for multiple structure alignment

机译：PMTM对齐的两级设计。在第1阶段，在火花群上实现成对结构对准（PSAS）。接下来，使用另一个脚本来从HDFS收集结果，然后发送到本地程序以进行多个结构对齐

著录项

期刊名称 BMC Bioinformatics
作者
Weiya Chen; Chun Yao; Yingzhong Guo; Yan Wang; Zhidong Xue;
展开▼
作者单位

展开▼
年(卷),期 2020(-1),-1
年度 2020
页码 -1
总页数 17
原文格式 PDF
正文语种
中图分类应用微生物学;生化遗传学;生化药理学;
关键词

机译：成对结构对齐;多种结构对齐;Apache Spark;OpenMP;

相似文献

外文文献
中文文献
专利

1. An effective sequence-alignment-free superpositioning of pairwise or multiple structures with missing data [J] . Jianbo Lu, Guoliang Xu, Shihua Zhang, Algorithms for Molecular Biology . 2016,第1期

机译：缺少数据的成对或多个结构的有效无序列比对叠加
2. Conservation of Amino Acids into Multiple Alignments Involved in Pairwise Interactions in Three-Dimensional Protein Structures [J] . Mounir Errami, Christophe Geourjon, Gilbert Deleage Journal of Bioinformatics and Computational Biology . 2003,第3期

机译：氨基酸保守参与三维蛋白质结构中成对相互作用的多重排列。
3. Conservation of Amino Acids into Multiple Alignments Involved in Pairwise Interactions in Three-Dimensional Protein Structures [J] . Mounir Errami, Christophe Geourjon, Gilbert Deleage Journal of Bioinformatics and Computational Biology . 2003,第3期

机译：氨基酸保守参与三维蛋白质结构中成对相互作用的多重排列。
4. PPCAS: Implementation of a Probabilistic Pairwise Model for Consistency-Based Multiple Alignment in Apache Spark [C] . Jordi Llados, Fernando Guirado, Fernando Cores International conference on algorithms and architectures for parallel processing . 2017

机译：PPCAS：Apache Spark中基于一致性的多重对齐的概率成对模型的实现
5. Parallel Feature Selection of Multiple Class Datasets Using Apache Spark [D] . Sankineni, Rishi 2017

机译：使用Apache Spark的多个类数据集的并行特征选择
6. An effective sequence-alignment-free superpositioning of pairwise or multiple structures with missing data [O] . Jianbo Lu, Guoliang Xu, Shihua Zhang, 2016

机译：缺少数据的成对或多个结构的有效无序列比对叠加
7. pmTM-align: scalable pairwise and multiple structure alignment with Apache Spark and OpenMP [O] . Weiya Chen, Chun Yao, Yingzhong Guo, 2020

机译：PMTM-align：可扩展的成对和与Apache Spark和OpenMP的多个结构对齐

pmTM-align: scalable pairwise and multiple structure alignment with Apache Spark and OpenMP

摘要

著录项

相似文献

相关主题

期刊订阅