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The mitogenome of freshwater loach Homatula laxiclathra (Teleostei: Nemacheilidae) with phylogenetic analysis of Nemacheilidae

机译:淡水泥HoHomatula laxiclathra(Teleostei:Nemacheilidae)的有丝分裂基因组与系统发育分析

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摘要

The complete mitogenome can provide valuable genetic information to reconstruct relationships between species. In this study, we sequenced a stone loach, (Teleostei: Nemacheilidae), which is found in the northern region of the Qinling Mountains in China. The size of the mitogenome is 16,570 bp, which contains 37 typical mitochondrial genes including 13 protein‐coding genes, 22 transfer RNAs, two ribosomal RNAs, and a control region (D‐loop) with a total AT content of 55.8%. This is similar to other Nemacheilidae sequences published in GenBank. Furthermore, a mito‐phylogenomic analysis of 46 Nemacheilidae species places in a robust monophyletic cluster with other species. Our results contribute toward a better understanding of a true phylogeny of these species based on large‐scale taxonomic samplings as well as to help grasp the evolution of fish mitogenomes.
机译:完整的有丝分裂基因组可以提供有价值的遗传信息,以重建物种之间的关系。在这项研究中,我们对石lo(Teleostei:Nemacheilidae)进行了测序,该石lo在中国秦岭北部地区发现。有丝分裂基因组的大小为16,570bp,包含37个典型的线粒体基因,包括13个蛋白质编码基因,22个转移RNA,两个核糖体RNA和一个控制区(D环),总AT含量为55.8%。这类似于GenBank中发布的其他线虫科序列。此外,对46种线虫科进行的线粒体系统分析表明,该科与其他物种在一个强大的单系集群中。我们的结果有助于基于大规模分类采样更好地了解这些物种的真实系统发育,并有助于掌握鱼类有丝分裂基因组的进化。

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