冷杉属叶绿体基因组比较与系统发育分析

摘要

以冷杉属10个物种的叶绿体全基因组为对象,分析其基因含量、重复序列等,重建冷杉属物种之间的系统进化关系。分析结果显示:冷杉属植物10个物种的叶绿体基因组大小在120057~121799 bp,基因个数在113~120,蛋白编码基因个数在71~74;冷杉属的10个物种中每一个物种的简单重复序列个数和分布情况存在差异,这可能是冷杉属植物在进化过程中不同物种的基因序列缺失、突变等原因造成;最大似然法与邻接法的系统发育树结果分为三支,南方红豆杉、西藏红豆杉、日本柳杉为一支,巴西南洋杉为一支,冷杉属10个物种为一支。在冷杉属,邻接法结果显示梵净山冷杉单独分为一支,其余9个物种分为一支;在最大似然法中欧洲冷杉与梵净山冷杉聚为一支,其余8个物种聚在一支。