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【2h】

Stochastic diffusion processes on Cartesian meshes

机译:笛卡尔网格上的随机扩散过程

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摘要

Diffusion of molecules is simulated stochastically by letting them jump between voxels in a Cartesian mesh. The jump coefficients are first derived using finite difference, finite element, and finite volume approximations of the Laplacian on the mesh. An alternative is to let the first exit time for a molecule in random walk in a voxel define the jump coefficient. Such coefficients have the advantage of always being non-negative. These four different ways of obtaining the diffusion propensities are compared theoretically and in numerical experiments. A finite difference and a finite volume approximation generate the most accurate coefficients.
机译:通过使它们在笛卡尔网格中的体素之间跳跃来随机模拟分子的扩散。首先使用网格上拉普拉斯算子的有限差分,有限元和有限体积近似推导跳跃系数。一种替代方法是让在体素中随机游走的分子的第一个出口时间定义跳跃系数。这样的系数具有总是非负的优点。从理论上和数值实验中比较了获得扩散倾向的这四种不同方式。有限的差异和有限的体积近似会生成最准确的系数。

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