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Modeling and inference for infectious disease dynamics: a likelihood-based approach

机译:传染病动态建模和推断:基于可能性的方法

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摘要

Likelihood-based statistical inference has been considered in most scientific fields involving stochastic modeling. This includes infectious disease dynamics, where scientific understanding can help capture biological processes in so-called mechanistic models and their likelihood functions. However, when the likelihood of such mechanistic models lacks a closed-form expression, computational burdens are substantial. In this context, algorithmic advances have facilitated likelihood maximization, promoting the study of novel data-motivated mechanistic models over the last decade. Reviewing these models is the focus of this paper. In particular, we highlight statistical aspects of these models like overdispersion, which is key in the interface between nonlinear infectious disease modeling and data analysis. We also point out potential directions for further model exploration.
机译:在涉及随机建模的大多数科学领域中,已经考虑了基于似然性的统计推断。这包括传染病动态,科学理解可以帮助捕获所谓机理模型中的生物过程及其可能性函数。但是,当这种机械模型的可能性缺乏闭合形式的表达时,计算负担就很大。在这种情况下,算法的发展促进了似然最大化,从而在过去十年中促进了对新型数据驱动机制模型的研究。回顾这些模型是本文的重点。特别是,我们强调了这些模型的统计方面,例如过度分散,这是非线性传染病建模与数据分析之间接口的关键。我们还指出了进一步模型探索的潜在方向。

著录项

  • 期刊名称 other
  • 作者

    Carles Bretó;

  • 作者单位
  • 年(卷),期 -1(33),1
  • 年度 -1
  • 页码 57–69
  • 总页数 21
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种
  • 中图分类
  • 关键词

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