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A chromosome-level draft genome of the grain aphid Sitobion miscanthi

机译:谷物蚜虫Sitobion miscanthi的染色体水平吃水基因组

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摘要

Background Sitobion miscanthi is an ideal model for studying host plant specificity, parthenogenesis-based phenotypic plasticity, and interactions between insects and other species of various trophic levels, such as viruses, bacteria, plants, and natural enemies. However, the genome information for this species has not yet to be sequenced and published. Here, we analyzed the entire genome of a parthenogenetic female aphid colony using Pacific Biosciences long-read sequencing and Hi-C data to generate chromosome-length scaffolds and a highly contiguous genome assembly.
机译:背景技术Sitobion miscanthi是研究宿主植物特异性,基于孤雌生殖的表型可塑性以及昆虫与各种营养级别的其他物种(例如病毒,细菌,植物和天敌)之间相互作用的理想模型。但是,该物种的基因组信息尚未进行测序和发布。在这里,我们使用Pacific Biosciences的长读测序和Hi-C数据分析了孤雌性蚜虫群体的整个基因组,以生成染色体长度的支架和高度连续的基因组组装。

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