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Modelling time course gene expression data with finite mixtures of linear additive models

机译:使用线性加性模型的有限混合对时程基因表达数据进行建模

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摘要

>Summary: A model class of finite mixtures of linear additive models is presented. The component-specific parameters in the regression models are estimated using regularized likelihood methods. The advantages of the regularization are that (i) the pre-specified maximum degrees of freedom for the splines is less crucial than for unregularized estimation and that (ii) for each component individually a suitable degree of freedom is selected in an automatic way. The performance is evaluated in a simulation study with artificial data as well as on a yeast cell cycle dataset of gene expression levels over time.>Availability: The latest release version of the R package flexmix is available from CRAN ().>Contact:
机译:>摘要:提出了线性加法模型的有限混合模型类。使用正则似然方法估计回归模型中特定于组件的参数。正则化的优点在于:(i)样条曲线的预定最大自由度比不规则估计的关键性要小,并且(ii)分别为每个组件自动选择合适的自由度。在仿真研究中使用人工数据以及随时间推移基因表达水平的酵母细胞周期数据集对性能进行了评估。>可用性: R包flexmix的最新发行版可从CRAN获得( )。>联系方式:

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