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CGAT: computational genomics analysis toolkit

机译:CGAT:计算基因组分析工具包

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摘要

>Summary: Computational genomics seeks to draw biological inferences from genomic datasets, often by integrating and contextualizing next-generation sequencing data. CGAT provides an extensive suite of tools designed to assist in the analysis of genome scale data from a range of standard file formats. The toolkit enables filtering, comparison, conversion, summarization and annotation of genomic intervals, gene sets and sequences. The tools can both be run from the Unix command line and installed into visual workflow builders, such as Galaxy.>Availability: The toolkit is freely available from >Contact:
机译:>摘要:计算基因组学通常通过整合和关联下一代测序数据来寻求从基因组数据集中得出生物学推断。 CGAT提供了广泛的工具套件,旨在帮助分析来自一系列标准文件格式的基因组规模数据。该工具包可对基因组间隔,基因组和序列进行过滤,比较,转换,汇总和注释。这些工具都可以从Unix命令行运行,也可以安装到可视工作流构建器(例如Galaxy)中。>可用性:该工具包可从>联系人:免费获得。

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