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SEED 2: a user-friendly platform for amplicon high-throughput sequencing data analyses

机译:SEED 2:用户友好的平台用于扩增子高通量测序数据分析

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摘要

MotivationModern molecular methods have increased our ability to describe microbial communities. Along with the advances brought by new sequencing technologies, we now require intensive computational resources to make sense of the large numbers of sequences continuously produced. The software developed by the scientific community to address this demand, although very useful, require experience of the command-line environment, extensive training and have steep learning curves, limiting their use. We created SEED 2, a graphical user interface for handling high-throughput amplicon-sequencing data under Windows operating systems.
机译:动机现代分子方法提高了我们描述微生物群落的能力。随着新测序技术带来的进步,我们现在需要大量的计算资源来理解连续产生的大量序列。科学界为解决这一需求而开发的软件虽然非常有用,但需要命令行环境的经验,广泛的培训以及陡峭的学习曲线,从而限制了它们的使用。我们创建了SEED 2,这是一个图形用户界面,用于在Windows操作系统下处理高通量扩增子测序数据。

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