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Prediction and analysis of protein solubility using a novel scoring card method with dipeptide composition

机译:使用具有二肽组成的新型评分卡方法预测和分析蛋白质的溶解度

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摘要

BackgroundExisting methods for predicting protein solubility on overexpression in Escherichia coli advance performance by using ensemble classifiers such as two-stage support vector machine (SVM) based classifiers and a number of feature types such as physicochemical properties, amino acid and dipeptide composition, accompanied with feature selection. It is desirable to develop a simple and easily interpretable method for predicting protein solubility, compared to existing complex SVM-based methods.
机译:背景技术现有的预测蛋白质在大肠杆菌中过表达的溶解度的方法通过使用基于整体的分类器(例如基于两级支持向量机(SVM)的分类器)和许多特征类型(例如理化特性,氨基酸和二肽组成)以及其功能来提高性能选择。与现有的复杂的基于SVM的方法相比,期望开发一种简单且易于解释的方法来预测蛋白质溶解度。

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