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GOLEM: an interactive graph-based gene-ontology navigation and analysis tool

机译:GOLEM:一种基于图的交互式基因本体导航和分析工具

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摘要

BackgroundThe Gene Ontology has become an extremely useful tool for the analysis of genomic data and structuring of biological knowledge. Several excellent software tools for navigating the gene ontology have been developed. However, no existing system provides an interactively expandable graph-based view of the gene ontology hierarchy. Furthermore, most existing tools are web-based or require an Internet connection, will not load local annotations files, and provide either analysis or visualization functionality, but not both.
机译:背景技术基因本体论已经成为分析基因组数据和构建生物知识的极其有用的工具。已经开发了几种用于导航基因本体的优秀软件工具。但是,没有现有的系统提供基因本体层次结构的基于交互式可扩展图的视图。此外,大多数现有工具都是基于Web的或需要Internet连接的,不会加载本地注释文件,并且提供分析或可视化功能,但不能同时提供两者。

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