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HumanMycobiomeScan: a new bioinformatics tool for the characterization of the fungal fraction in metagenomic samples

机译:HumanMycobiomeScan:一种新的生物信息学工具用于鉴定宏基因组样品中的真菌级分

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摘要

BackgroundModern metagenomic analysis of complex microbial communities produces large amounts of sequence data containing information on the microbiome in terms of bacterial, archaeal, viral and eukaryotic composition. The bioinformatics tools available are mainly devoted to profiling the bacterial and viral fractions and only a few software packages consider fungi. As the human fungal microbiome (human mycobiome) can play an important role in the onset and progression of diseases, a comprehensive description of host-microbiota interactions cannot ignore this component.
机译:背景技术对复杂微生物群落的现代宏基因组学分析产生了大量的序列数据,其中包含有关细菌,古细菌,病毒和真核生物组成方面的微生物组信息。可用的生物信息学工具主要用于分析细菌和病毒级分,只有少数软件包考虑真菌。由于人类真菌微生物组(人类真菌组)可以在疾病的发作和发展中发挥重要作用,因此宿主微生物群相互作用的全面描述不能忽略该成分。

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