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Transfer of energy pathway genes in microbial enhanced biological phosphorus removal communities

机译:能量途径基因在微生物增强的生物除磷群落中的转移

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摘要

BackgroundLateral gene transfer (LGT) is an important evolutionary process in microbial evolution. In sewage treatment plants, LGT of antibiotic resistance and xenobiotic degradation-related proteins has been suggested, but the role of LGT outside these processes is unknown. Microbial communities involved in Enhanced Biological Phosphorus Removal (EBPR) have been used to treat wastewater in the last 50 years and may provide insights into adaptation to an engineered environment. We introduce two different types of analysis to identify LGT in EBPR sewage communities, based on identifying assembled sequences with more than one strong taxonomic match, and on unusual phylogenetic patterns. We applied these methods to investigate the role of LGT in six energy-related metabolic pathways.
机译:背景侧向基因转移(LGT)是微生物进化中的重要进化过程。在污水处理厂中,已经提出了具有抗药性和异源生物降解相关蛋白的LGT,但是在这些过程之外LGT的作用尚不清楚。在过去的50年中,参与增强型生物除磷(EBPR)的微生物群落已被用于处理废水,并可能提供对适应工程环境的见解。我们介绍两种不同类型的分析,以识别EBPR污水社区中的LGT,这是基于识别具有多个强分类匹配的装配序列以及不寻常的系统发育模式。我们应用这些方法来研究LGT在六个与能量相关的代谢途径中的作用。

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