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Gene selection algorithm by combining reliefF and mRMR

机译:结合reliefF和mRMR的基因选择算法

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摘要

BackgroundGene expression data usually contains a large number of genes, but a small number of samples. Feature selection for gene expression data aims at finding a set of genes that best discriminate biological samples of different types. In this paper, we present a two-stage selection algorithm by combining ReliefF and mRMR: In the first stage, ReliefF is applied to find a candidate gene set; In the second stage, mRMR method is applied to directly and explicitly reduce redundancy for selecting a compact yet effective gene subset from the candidate set.
机译:BackgroundGene表达数据通常包含大量基因,但样本数量很少。基因表达数据的特征选择旨在找到最能区分不同类型生物样品的一组基因。在本文中,我们提出了一种结合ReliefF和mRMR的两阶段选择算法:第一阶段,将ReliefF用于寻找候选基因集;在第二阶段,将mRMR方法应用于直接和显式减少用于从候选集中选择紧凑而有效的基因子集的冗余。

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