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SLIMEr: probing flexibility of lipid metabolism in yeast with an improved constraint-based modeling framework

机译:SLIMEr:通过改进的基于约束的建模框架来探索酵母中脂质代谢的灵活性

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摘要

BackgroundA recurrent problem in genome-scale metabolic models (GEMs) is to correctly represent lipids as biomass requirements, due to the numerous of possible combinations of individual lipid species and the corresponding lack of fully detailed data. In this study we present SLIMEr, a formalism for correctly representing lipid requirements in GEMs using commonly available experimental data.
机译:背景技术由于单个脂质种类的众多可能组合以及相应缺乏全面详细的数据,基因组规模代谢模型(GEM)中的一个经常出现的问题是正确地将脂质表示为生物量需求。在这项研究中,我们介绍了SLIMEr,这是一种使用常用实验数据正确表示GEM中脂质需求的形式。

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