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Biophysical and computational methods to analyze amino acid interaction networks in proteins

机译:分析蛋白质中氨基酸相互作用网络的生物物理和计算方法

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摘要

Globular proteins are held together by interacting networks of amino acid residues. A number of different structural and computational methods have been developed to interrogate these amino acid networks. In this review, we describe some of these methods, including analyses of X-ray crystallographic data and structures, computer simulations, NMR data, and covariation among protein sequences, and indicate the critical insights that such methods provide into protein function. This information can be leveraged towards the design of new allosteric drugs, and the engineering of new protein function and protein regulation strategies.
机译:球状蛋白通过氨基酸残基的相互作用网络保持在一起。已经开发出许多不同的结构和计算方法来询问这些氨基酸网络。在这篇综述中,我们描述了其中一些方法,包括对X射线晶体学数据和结构的分析,计算机模拟,NMR数据以及蛋白质序列之间的协变,并指出了这些方法对蛋白质功能的关键见解。该信息可用于设计新的变构药物,以及设计新的蛋白质功能和蛋白质调控策略。

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