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Time-lapse confocal imaging datasets to assess structural and dynamic properties of subcellular nanostructures

机译:延时共聚焦成像数据集以评估亚细胞纳米结构的结构和动力学特性

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摘要

Time-lapse optical microscopy datasets from living cells can potentially afford an enormous amount of quantitative information on the relevant structural and dynamic properties of sub-cellular organelles/structures, provided that both the spatial and temporal dimensions are properly sampled during the experiment. Here we provide exemplary live-cell, time-lapse confocal imaging datasets corresponding to three sub-cellular structures of the endo-lysosomal pathway, i.e. early endosomes, late endosomes and lysosomes, along with detailed guidelines to produce analogous experiments. Validation of the datasets is conducted by means of established analytical tools to extract the structural and dynamic properties at the sub-cellular scale, such as Single Particle Tracking (SPT) and imaging derived Mean Square Displacement (iMSD) analyses. In our aim, the present work would help other researchers in the field to reuse the provided datasets for their own scopes, and to combine their creative approaches/analyses to similar acquisitions.
机译:只要在实验过程中对空间和时间维度进行适当采样,活细胞的延时光学显微镜数据集就可以潜在地提供有关亚细胞器/结构相关结构和动态特性的大量定量信息。在这里,我们提供了与内溶酶体途径的三个亚细胞结构相对应的示例性活细胞,延时共聚焦成像数据集,即早期内体,晚期内体和溶酶体,以及产生类似实验的详细指南。借助已建立的分析工具对数据集进行验证,以提取亚细胞尺度的结构和动力学特性,例如单粒子跟踪(SPT)和成像衍生的均方位移(iMSD)分析。在我们的目标中,当前的工作将帮助该领域的其他研究人员将提供的数据集重新用于他们自己的范围,并将他们的创造性方法/分析与类似的采集相结合。

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