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Model-based cluster analysis of microarray gene-expression data

机译:基于模型的微阵列基因表达数据的聚类分析

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摘要

BackgroundMicroarray technologies are emerging as a promising tool for genomic studies. The challenge now is how to analyze the resulting large amounts of data. Clustering techniques have been widely applied in analyzing microarray gene-expression data. However, normal mixture model-based cluster analysis has not been widely used for such data, although it has a solid probabilistic foundation. Here, we introduce and illustrate its use in detecting differentially expressed genes. In particular, we do not cluster gene-expression patterns but a summary statistic, the t-statistic.
机译:背景技术微阵列技术正在成为基因组研究的有前途的工具。现在的挑战是如何分析由此产生的大量数据。聚类技术已广泛应用于分析微阵列基因表达数据。但是,尽管基于常规混合模型的聚类分析具有坚实的概率基础,但尚未广泛用于此类数据。在这里,我们介绍并说明其在检测差异表达基因中的用途。特别是,我们不对基因表达模式进行聚类,而是对摘要统计量(t统计量)进行聚类。

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