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A distance-type measure approach to the analysis of copy number variation in DNA sequencing data

机译:一种距离类型的测量方法用于分析DNA测序数据中的拷贝数变异

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摘要

BackgroundThe next generation sequencing technology allows us to obtain a large amount of short DNA sequence (DNA-seq) reads at a genome-wide level. DNA-seq data have been increasingly collected during the recent years. Count-type data analysis is a widely used approach for DNA-seq data. However, the related data pre-processing is based on the moving window method, in which a window size need to be defined in order to obtain count-type data. Furthermore, useful information can be reduced after data pre-processing for count-type data.
机译:背景技术下一代测序技术使我们能够在全基因组范围内获得大量的短DNA序列(DNA-seq)读数。近年来,越来越多地收集DNA-seq数据。计数类型数据分析是用于DNA序列数据的一种广泛使用的方法。但是,相关数据预处理基于移动窗口方法,其中需要定义窗口大小以获得计数类型数据。此外,在对计数类型数据进行数据预处理之后,可以减少有用的信息。

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