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A systematic search for SNPs/haplotypes associated with disease phenotypes using a haplotype-based stepwise procedure

机译:使用基于单倍型的逐步过程系统搜索与疾病表型相关的SNP /单倍型

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摘要

BackgroundGenotyping technologies enable us to genotype multiple Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) within selected genes/regions, providing data for haplotype association analysis. While haplotype-based association analysis is powerful for detecting untyped causal alleles in linkage-disequilibrium (LD) with neighboring SNPs/haplotypes, the inclusion of extraneous SNPs could reduce its power by increasing the number of haplotypes with each additional SNP.
机译:背景基因分型技术使我们能够对选定基因/区域内的多个单核苷酸多态性(SNP)进行基因分型,从而为单倍型关联分析提供数据。尽管基于单倍型的关联分析功能强大,可以检测连锁不平衡(LD)与相邻SNP /单倍型中未分型的因果等位基因,但包含无关的SNP可能会通过增加每个附加SNP的单倍型数量而降低其功效。

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