基于高通量测序的技术检测梨树病毒

摘要

[目的]研究运用基于高通量测序的技术检测梨树病毒,为梨树病毒的检测提供新方法.[方法]于2014年、2017年、2018年4月中旬采集库尔勒香梨花朵若干,分别进行转录组测序,将得到的序列经过转录本拼接、层次聚类和基因功能注释,筛选出注释为植物病毒的序列作为候选病毒序列.利用RT-PCR方法检测随机采集的香梨枝条样品,验证高通量测序结果的可靠性.[结果]根据3组转录组测序数据的生物信息学分析结果,分别对注释为来源于植物病毒的66、202和921条基因序列进行分析.3种梨树中已报道的病毒,分别是苹果茎痘病毒、苹果茎沟病毒和苹果褪绿叶斑病毒,以及梨树中未报道的芸薹黄化病毒.采用设计的特异性引物,通过RT-PCR技术对筛选出的4种病毒进行扩增验证,结果扩增出苹果茎痘病毒和苹果茎沟病毒的目的片段.[结论]高通量测序技术可作为检测梨树病毒的一种快速、有效手段.