基于网络药理学与分子对接探讨土家药复方竹节参片对肝损伤的作用机制

摘要

应用网络药理学及分子对接技术,探讨土家药复方竹节参片治疗肝损伤(Liver injury,LI)的物质基础及作用机制。从TCMSP数据库和中国知网数据库中提取复方竹节参片的化合物及靶点信息;Uniprot网站将靶点信息转换为Gene,将中药-成分-Gene信息导入Cytoscape V3.8.2获得中药-成分-Gene网络;利用OMIM、GeneCards和DrugBank网站提取“Liver injury”的疾病Gene,Excel绘制Venn图获得成分-疾病交集靶点,并构建交集靶点-成分网络图确定核心成分;利用STRING网站获得交集靶点的蛋白互作(PPI)网络及核心靶点,Matascape网站对核心靶点进行基因本体(GO)功能、京都基因和基因组数据库(KEGG)通路富集分析;用AutoDock工具进行核心成分与核心靶点的分子对接。复方竹节参片中共筛选出68种有效活性成分,治疗LI的核心成分有槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、木犀草素、(20S)-原人参二醇和β-胡萝卜素等;治疗LI的核心靶点15个,分别为STAT3、JUN、AKT1、TP53、TNF、MAPK1、IL6、RELA、VEGFA、MAPK8、MAPK14、PIK3CA、MYC、CTNNB1和FOS。靶点主要涉及调节与DNA结合的转录因子活性、蛋白激酶活性、细胞氧化应激及炎症反应、癌症相关蛋白的表达和血管生长等生物学过程;重要通路有乙型和丙型肝炎病毒途径、癌症及癌症中的蛋白多糖、流体剪切应力和动脉粥样硬化、糖尿病并发症中的AGE-RAGE、TNF、Toll样受体和MAPK等信号通路。分子对接结果显示,核心成分与关键靶点的结合活性良好。本研究表明,复方竹节参片可能通过作用于上述STAT3、JUN和AKT1等核心靶点,参与相关生物进程及通路的调节,进而发挥对LI的多成分-多靶点-多通路的治疗作用,本文为进一步研究复方竹节参片对LI的作用机制提供理论参考。