旧院黑鸡TYR基因第四内含子中ALV的插入频率和类型研究

摘要

有研究表明TYR基因第四内含子中ALV的插入缺失与禽类的羽毛颜色有关,本研究旨在探讨旧院黑鸡TYR基因第四内含子中ALV的插入频率和类型,为进一步探讨其与旧院黑鸡羽毛颜色的相关性提供参考。采用双重PCR对ALV插入整合进行检测、测序,DNA测序序列通过相关分子生物学软件比对与分析,从而分析序列中的识别位点和突变位点。用引物Diag05-dw进行测序,可以看出在不含ALV插入整合频率的N片段中,只存在一个6 bp的识别位点5′-CAGTGT-3′;将不含ALV插入整合频率的N片段的测序结果与参考序列DQ118702.1进行比对,共发现有5个SNP,这5个SNP都位于第四内含子,重要的识别位点5′-CAGTGT-3′存在一个SNP位点5890 G/A。