心脏外科手术后房颤差异表达基因筛选及功能分析

摘要

目的 筛选心脏外科手术后房颤(POAF)的差异表达基因,并进行功能分析.方法 从GEO数据库获取1个基因表达谱数据集GSE143924,样本来源于心外科手术患者心外膜脂肪组织.根据术前特征对15例POAF患者(病例组)和15例术后窦性心律患者(对照组)进行匹配.通过GEO2R在线分析病例组和对照组差异表达基因,对差异表达基因进行GO分析及KEGG分析,构建蛋白与蛋白相互作用(PPI)网络,筛选Degree前10位的基因为POAF的关键基因.结果 共筛选获得病例组和对照组的254个差异表达基因,病例组较对照组表达上调82个、表达下调172个.GO和KEGG分析显示,差异表达基因涉及的信号通路主要与补体和凝血级联等相关,生物学过程主要集中在细胞黏附、免疫反应等.PPI网络筛选得到10个关键基因分别为TLR2、CDH2、VTN、CCL2、KDR、C1QA、BMP2、ZAP70、HP、CFB,这些基因主要调控炎症反应及免疫反应.结论 POAF差异表达基因涉及的信号通路主要与补体和凝血级联等相关,生物学过程主要集中在细胞黏附、免疫反应等,炎症反应和免疫反应在POAF的发生发展中起关键作用.