川崎病患儿差异表达基因筛选及相应蛋白表达观察

摘要

目的 运用生物信息学方法分析川崎病(KD)患儿差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并观察KD患儿血清中相应DEGs蛋白的表达变化.方法 ①KD患儿DEGs筛选:从KD数据库中获取KD的基因组数据,通过R软件中edgeR软件包分析KD患儿及健康儿童DEGs.②KD患儿DEGs蛋白表达观察:典型KD患儿40例,健康儿童15例,抽取外周静脉血,采用ELISA双抗体夹心法检测基质金属蛋白酶8(MMP-8)、嗅介蛋白-4(OLFM4)蛋白.结果 与健康儿童相比,KD患儿存在288个DEGs,其中表达明显上调基因186个、明显下调基因102个.MMP-8基因和OLFM4基因差异最为明显(P均<0.05).KD患儿外周血MMP-8、OLFM4蛋白表达水平分别为(73.21±13.66)、(26.37±5.88)ng/mL,健康儿童分别为(46.32±9.38)、(9.37±5.23)ng/mL,二者比较,P均<0.05.结论 KD患儿有MMP-8、OLFM4等288个DEGs.KD患儿外周血中MMP-8、OLFM4蛋白表达水平升高.